Question

Sobre as análises de transcriptoma diferencial utilizando a metodologia RNA-seq, é correto afirmar que:

Accepted Answer

B) é possível realizar análises e agrupamentos (assemblies) de transcriptomas sem a necessidade de um genoma de referência, o chamado “de novo assembly”.

Answer

A) as novas tecnologias de sequenciamento não podem ser utilizadas nas metodologias de RNA-seq atuais, pois a transcriptase reversa não é compatível com esses novos métodos.

Answer

C) dentre as métricas para acessar a qualidade de um transcriptoma encontra-se a medida de qualidade de um agrupamento (assembly) que inclui a média do tamanho dos fragmentos, número de fragmentos gerados e N30.

Answer

D) genes de maior tamanho terão menor número de fragmentos/leituras sequenciadas que genes menores, se a expressão do transcrito for a mesma. A expressão dos genes é ajustada pela divisão dos fragmentos sequenciados pelo tamanho do gene, resultando na métrica: fragmentos por kilobase do transcrito por milhões de leituras mapeadas (FPKM).

Answer

E) a expressão gênica varia dentro e entre tecidos, e o RNA-seq mede a expressão com mistura entre tipos celulares. Até o presente momento não é possível realizar RNA-seq com uma única célula, sendo 2x106 o número mínimo recomendado de células.

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